1. 想自學生物信息學,不知道怎麼開始,有沒有什麼好的推薦
想學習生物信息學可以首先購買相應的書籍,其次可以關注慕課或者是一些其他的網站,上面有很多免費的一些課程可以自己看。
2. 如何自學生物信息學
1,從現有的生物信息學工具開始,要熟悉如何利用先用的軟體、網路伺服器、資料庫等等,為生物研究服務,不要做重復工作,能用現成的就不自己開發。
2,熟悉命令行的操作系統,DOS,Linux,可以編寫簡單的shell;進而能安裝命令行級的程序,跑一些常規的流程。要學習如何尋找和安裝軟體,這是最重要也是最基本的技能。其實很多問題,如果找到合適的軟體包,都是迎刃而解的。
3,熟悉一種簡單的腳本語言,個人推薦用python,具體原因可以見我的帖子。在沒有現成工具時,或需要數據格式轉換時,小的腳本是非常有用的。一般的應用無需自己寫太多的代碼,要相信我們通常遇到的問題,別的高手可能早就遇到了,所以網路上有大量的工具包。至於更多的編程語言,一門精則門門通,R,perl等都是類似的。
4,熟悉簡單的演算法和數據結構的知識,這樣就可以理解很多程序的內在機制,進而知道它們的優點和缺點,對自己寫程序也有幫助。有精力的話,進而學習統計、機器學習等。。
5,在自己的生物領域內擴展,調研,分析,開發。
3. 北京市計算中心的實用生物信息學培訓研習班怎麼樣
還可以 講的比較基礎 之前參加過 還是很有收獲的
4. 有誰參加過華大生物信息學培訓嗎 我對編程一點也不懂,參加這培訓班能跟上嗎
這個培訓不需要編程的知識,當然懂一點還是有好處的。主要是軟體的介紹和使用,最新的生物信息學知識等,至少在我們學校做的培訓是這樣的。
5. 如何自學生物信息學
先說一下自己吧,我碩士讀的是細胞生物學,今年4月開始在boss要求下自學perl,打聽了下,這本書不錯,就買來開始看,等5月份去北京參加公司的培訓班時,讀了一遍,看了一部分。培訓回來,我們的項目就開始做了,9月拿到所有原始數據和分析結果。然後,我對照著公司的分析報告,試著自己走一邊分析流程,中間遇到問題,自己解決不了的,就發郵件求助。有幾點需要注意:
1. 我能理解你想早些玩兒數據的願望,但是在這之前,最好要有一個outline.需要知道數據從哪兒來的,怎麼產生的?其實就是測序儀的工作原理。然後是數據質量檢驗,為什麼需要數據過濾?接著是reads拼接和組裝。總之,要對整個流程有一個認識,而後在學習的過程中,再不斷回頭對比這個流程,這樣才不會有迷失的感覺。[這本書](BioInformatics for High Throughput Sequencing)推薦看一下。
2. 有了基礎知識的鋪墊,就可以嘗試著自己做些練習了,paper上面都會給出他們的數據、原碼地址,可以找來自己試試,先看看自己能不能做出一樣的效果。當然,這時要是你手裡正好有項目,那就更好了。
3. 學生物信息,paper肯定是要跟蹤的。這兩個網站可以經常看一下:
[homologous](Homologus - Frontier in Bioinformatics) 覆蓋生物信息有趣的論文, 演算法,以及生物科學問題。這個網站還匯集了很多生物信息領域科學家的博客。再如BGI的主程羅瑞邦, SAMtools、BWA的作者Heng Li都有在這里出現。
[rna-seq Blog](RNA-Seq Blog) 推薦新的論文、工作、培訓課程、大型會議等。
如果你是生物背景的,那麼計算機方面的知識需要補一下:
- 需要能在linux環境下舒服的工作。比如從源碼編譯安裝軟體、PATH配置,再比如舒服地使用google找到問題的答案 :-)
- 學會使用python/perl。比如有的時候運行一個軟體老是報錯,可能就是因為在一個包含幾十萬行的文本文件里,有隨機的那麼幾千行的末個位置,多一個冒號,[就像這里](using HTSeq | popucui), 這時候你知道需要怎麼做了?
- 學會R。要從一大堆基因裡面找出表達水平變化的基因來,需要統計分析和顯著檢驗;而要把我們的數據更直觀地展示出來,最好的方式就是圖形了吧。這兩個需要,R都能滿足。當然matlab也是可以的,區別在於R是開源工具。
- 具備了上述技能,那麼常用的軟體就能用起來了。隨著學習的深入,可能你的問題別人也沒遇到過,這時候就需要自己動手,要麼修改現成的工具,要麼自己做一個出來。這時候,除了python/perl,或許還可以學學C/C++/java,或許需要研究下比如BWT、De Bruijn Graph背後的原理。
6. 請教如何學習生物信息學
首先得了解生物信息學做什麼。推薦一本入門的書:《探索基因組學、蛋白質組學和生物信息學》,這本書基本上把現在用到的生物信息的基本技術講了一遍。
然後是學會如何應用現有的工具。現在有很多已經寫好的工具,只要會看幫助文檔,對於解決手頭的工作是提供了相當大的幫助。
學習一門語言。python,perl,R,都可以,只要能夠幫自己解決問題就好。
7. 生物信息學的前景
生物信息學其實目前的發展,個人覺得就是用計算機的強大運算能力來解決生物實驗中出現的大量數據,並期待在其中發現更多生物的規律以及特點。
個人認為計算機已經成為了一個世界的核心工具,什麼領域都快要離不開計算機了,計算機分析金融已經不是什麼很新鮮的事情了,計算機解決數學物理問題更是司空見慣,學建築的和土木的需要用計算機制圖,使用CAD等軟體,就算是搞商業的也需要用到Excl等等……所以計算機與生物的綁定,其實應該是一種必然出現的趨勢吧,所以個人覺得,這個領域會發展的很快很快(而且目前的確是這樣的)。
至於說未來,我覺得有幾種趨勢:首先就是應用於研究領域,毫無疑問現在很多大學和研究所都已經有了相應的計算生物領域的分支了,通過學計算機的人和數學的人編寫程序分析查找海量的生物數據中的規律,然後在將猜測到的結果告知生物學家,讓他們做實驗驗證假設,這就是我未來的工作(這不稀奇,現在各個領域的研究都很依賴計算機了,之所有血淋淋的生物最晚於計算機掛鉤,那是因為生物學科本來就是人類深入最淺的一門學科)。
另外我覺得生物信息將會真正意義上引爆生物的革命,個人覺得無論什麼研究領域,只有轉化為應用,作用於社會與世界才真正有意義,現在開始出現的個人基因組測序已經是生物產業出現的前兆,比如Affymatrix,華大基因等等……但是大量的數據根本沒有人讀得懂!生物信息的第一個應用我覺得就會出現在生物數據的解釋上,這就類比於,每個人都可以查詢到海量的股票信息,但是只有特定的Analysis可以發現其中蘊含的商機一樣!可以想像,如果一群人破解了一大堆人類的有關於生老病死的基因信息,但是他們不公開,他們需要你繳費,然後給你測序(以後測序會非常非常便宜的,我估計就會像現在每人必須有身份證一樣普遍),然後幫你分析,你有什麼疾病……等等。這樣的產業出現與微軟有什麼差別!!完全沒有!!微軟存在的基礎是計算機的普及,我設想的生物公司的基礎是測序的普及,微軟提供自己的軟體,你必須買,生物公司提供自己公司內部的數據資料,幫你分析(類似於做一次咨詢)……這是我個人的一點想法是一種比較直接的使用生物信息技術的手段。
至於其他,計算機的運用應該會深入到方方面面,因為我覺得一切其他的領域都已經被計算機插足了,農業的灌溉系統是全自動的,機床是數控的,顯微鏡是電子的,華爾街的數據每天有無數的計算機在分析……這一切都是計算機普及之後的30年之內實現的,所以生物信息個人覺得前景還是很強大的。之前一直在說的DNA計算機,我覺得相反比較難實現……因為我很久沒有聽說相關進展了,我感覺下一代計算機是量子的更可能,但這並不妨礙什麼,因為我個人覺得,計算機僅僅是一個工具,一個任何領域都離不開的工具而已,以後任何人都需要掌握這一門工具,就像是現在中國幾乎所有的在校大學生都能說幾句英語一樣普及。
補一句吧,這個領域目前還是集中在研究領域,就業相比於其他工科專業還是要差一些的,不過個人感覺相比於純生物領域好很多,工資狀況影響因素很多,大學城市都有影響,不過總體來說,目前這個領域遠遠不如如日中天的IT,我是計算機學院的,IT的發展速度已經早表明,計算機的時代遠遠的沒有到結束的那一天,未來十幾年甚至幾十年,我個人覺得工資上IT人依然會笑傲工科領域……如果你很在意工資就業什麼的,我挺推薦計算機的,IT的世界是很公平的,而且確實壓力與機遇並存,如果你努力,一般都會獲得成功,很適合年輕人。
以上均為個人感想而已拉 ^_^ ,很多其實應該都是錯的,還望指正
8. 生物信息學專業需要學習哪些東西
生物信息學專業主要的課程有:
主幹課程:生物學、數學、計算機科學。
課程設置:
普通生物學、生物化學、分子生物學、遺傳學、生物信息學、計算生物學、基因組學、生物晶元原理與技術、蛋白質組學、模式識別與預測、資料庫系統原理、Linux基礎及應用、生物軟體及資料庫、Perl編程基礎等。
9. 生物信息學本科階段學習哪些課程
生物信息專業
培養目標:本專業培養德智體美全面發展,具備生物信息學的基本理論、基本知識和基本技能,並能在高校或科研機構和政府機構及相關行業的企業、事業部門等從事生物信息和生物信息軟體、產品的研究與教學、生產與開發、經營與管理等方面工作的復合型科技人才,以及為相關專業輸送高水平的研究生。
專業特色:生物信息學是分子生物學和計算機科學相互交叉形成的新興前沿學科。本專業是根據21世紀最具市場活力的新興生物信息產業市場需求而設置的新專業。培養具有計算機技術背景,通曉分子生物學知識,熟練運用生物信息處理軟體的生物學——計算機兩棲復合應用型高級專業技術人才。本專業所屬院系與之相關的學科有省重點學科3個,博士點2個,碩士點5個;所培養的學生在分子遺傳與基因工程、生物信息處理與應用、計算機應用等領域具有顯著的優勢和特色。
就業前景:本專業是二十一世紀最具發展前景的專業之一,學生畢業後可在高校和科研院所從事生物信息相關的研究和教育工作,各級人民政府及其下屬單位從事生物信息和基因產品的行政管理工作,能在相關行業的企事業部門從事與生物信息有關的應用研究、軟體開發、生產管理、技術推廣等工作。
主要課程:生物學、分子生物學、生物信息學、生物信息資料庫原理與應用、生物信息軟體及應用、信息科學原理、計算機應用基礎、計算機高級語言、信息組織學、信息系統分析與設計、人工智慧與專家系統、計算機網路等。
另外要會編程,學幾個語言,C++或JAVA,再學個Perl,還最好會Linux
生物專業的課,要學好細胞,遺傳,分子生物學
考研的話,大多考生化、分子、細胞或離散中的兩門
大學里的生物工程排行榜
建議你去看看這里的信息
http://bbs.rank98.com/read.php?tid=2671&fpage=1
http://e.qq.com/zt/2005/dxphb/paihang.htm
http://learning.sohu.com/6/0104/17/blank218541753.shtml
沒有找到生物工程專業的排名,但是我了解的,北大在這個方面是最好的。
10. 什麼人適合學習生物信息學
晚上好!很高興為您解答:首先是有興趣學習這個專業,其次有一顆堅持不懈的精神。
就業前景:在科研機構、高等學校、醫療醫葯、環境保護等相關部門從事教學、科研、管理、疾病分子診斷、葯物設計、生物軟體開發、環境微生物檢測等工作。
就生物信息學學科來講,前景十分廣闊。這是研究生命本質的學科,其目的是期望從基因序列上解開一切生物的基本奧秘,從結構上獲得生命的生理機制,這從哲學上來看是期望從分子層次上解釋人類的所有行為和功能,只是難度很大。
總的來說,做科研前景較好,不做科研只能找比較一般的工作。